Biologie Moléculaire et Génétique des Microorganismes

   notre démarche s?inscrit dans un objectif à plusieurs impacts. Dans une réflexion globale, nous portons un intérêt particulier au diagnostic et à l?identification des isolats par les méthodes de Biologie Moléculaire à base de PCR. L'une des priorités majeure de cette étude viserait la constitution d'une collection de microorganismes à effet probiotique et prébiotique (banque de souches). Les isolats qui auront démontré une activité inhibitrice contre les pathogènes de type Staphylococcus, Salmonella, Campylobacter, Clostridium et principalement contre les coccidies du genre Eimeria (Lee et al., 2007 ; Tierney et al., 2004) seront retenus, répertoriés et stockés à -80°C. Une production de microorganismes d?intérêt en masse sera préconisée par l?utilisation d?un fermenteur pilote. Ces souches probiotiques seront lyophilisées pour une éventuelle utilisation en cheptel pilote soit en alimentation soit par abreuvement. Au cours de ces dernières années, on a reconnu des propriétés prébiotiques à plusieurs substances, à ce titre, des prébiotiques de type biofilm EPS (exoploysaccharides) d?origine microbiologique ont été obtenus à partir de souches isolées de tractus digestif de volaille fermière dans notre laboratoire, leur caractérisation et leurs effets seront préconisés à court, moyen et long terme. Dans un dernier chapitre, différentes études seront entreprises afin de comprendre de manière plus approfondie les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans l?interaction microorganisme/cellules hôtes telles que la microscopie à fluorescence, la cytométrie en flux (FACS), la spectrofluorimétrie ou encore les techniques de dosage immuno-enzymatique (Elisa) afin de montrer une éventuelle production de facteurs ayant des propriétés anti-virales, -bactériennes ou ?microorganismes parasitaires.